М.Степанов женат, у него двое детей. Старшей дочери 18 лет, она учится на втором курсе Бостонского университета (США), а восьмилетний сын ходит в школу.

Семья проживает в Киеве, где работает его супруга. Она также медик по образованию (первое образование М.Степанова - медицинское, второе - экономическое) и является главным научным сотрудником Института нефрологии Академии медицинских наук и преподает в Киевском медицинском институте.

М.Степанов отметил, что у его супруги очень сложная работа, так как она занимается тяжело больными, в основном проходящими гемодиализ.

Чиновник добавил, что является обеспеченным человеком. Декларацию о доходах за 2016 год заполнил, и вскоре она будет доступна для всех интересующихся.